Este é o material original que foi produzido antes do lançamento da nova apostila, na primeira fase deste blog. Uma parte deste material pode se repetir na apostila nova, mas será mantido por aqui para referência.
Dica: como salvar os scripts do blog
1 – A boa e velha apostila de introdução ao R
2 – Scripts do Curso do R no IPÊ (em 2014)
3 – Gráficos: nomes de eixos e algumas coisas a mais
4 – Dados e pastas parte 1: estabelecendo um diretório de trabalho
5 – Como tirar dúvidas sobre o R?
6 – Um guia em vídeo sobre como salvar os scripts aqui do blog.
7 – A incrível batalha estatística das bandas de Heavy Metal!
8 – Números absurdos, escalas distorcidas e personagens de Game of Thrones
10 – E conheça, também, a lista R-br!
12 – Gráficos de média no R, sem precisar carregar pacotes
13 – Gráficos passo a passo e bancos de dados no R
15 – Um compêndio de gráficos no R, com scripts prontinhos pra usar
16 – Um boxplot de médias (e aprendendo mais coisinhas sobre gráficos no R)
17 – Sobreposição de histogramas
18 – Curvas de acúmulo de espécies bonitinhas
19 – Pokemons e correlações no R
20 – Conectando o EstimateS e o R
22 – Tieplots: Gráficos de muito tempo atrás, de uma galáxia muito distante…
23 – Um tutorial de RMarkdown!
24 – Um tutorial de Memes no R!
Cantinho do R 
Parabéns professor ótimos materiais. eu precisava saber mais sobre os dados nos mapas o senhor indica algo, ou material é para minha dissertação.
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Obrigado, Rodrigo!
Veja só, uma ótima fonte de informação sobre como lidar com mapas no R é este manual do pacote dismo: https://cran.r-project.org/web/packages/dismo/vignettes/sdm.pdf
Ele é sobre modelagem de distribuição, mas os capítulos iniciais passam por várias questões úteis sobre como usar o R como um SIG. Acho um ótimo começo para se lidar com isso.
Abraços!
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Muito Grato Professor, Obg mesmo.
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Olá professor, bom dia.
Gostei muito do blog, das dicas e da apostila sobre o R.
Com certeza esse material me ajudará muito a entender e produzir melhor com o auxilio do R.
Abraço.
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Oi, Betânia!
Obrigado! Fico muito feliz de saber que o material vai te ajudar.
E no momento estamos reformulando a nossa apostila, então teremos várias novidades nos próximos meses, ok?
Abraços!
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Professor, ajude! estou cadastrada nesse curso http://cursos.escas.org.br/programa-r-para-biologia-da-conservacao-lista-de-espera , já estou cadastrada e assisti a primeira aula….. mas não sei onde faço login para ver as outras…. poderia me ajudar?
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Olá!
Então, as inscrições já terminaram, e não sei ao certo se os outros vídeos estão disponíveis. Entre contato com o pessoal da Bocaina, ok?
Escreva para eles no email contato ‘arroba’ bocaina ‘ponto’ bio ‘ponto’ br
Abraços!
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Cada vez mais ganhando prestígio e respeito, parabéns Prof. Marcos Vital… 🙂
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Obrigado, Lázaro!
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Boa Tarde Professor Marcos,
Estou dando os meus primeiros passos no programa R, e os arquivos disponíveis no seu blog, juntamente com os os vídeos do seu canal no YouTube, tem me auxiliado bastante.
Os textos e os vídeos são bem didáticos.
Parabéns pelo trabalho e muito obrigada por realizar essa transferência de conhecimento.
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Muito obrigado, Jessica, fico muito feliz de saber que o material está ajudando!
Abraços!
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Olá professor, estou com dificuldades para usar o pacote do FAOstat no R, será q vc pode me passar algumas dicas ou algum material? Não encontrei muita coisa na rede, imagino que seja fácil, mas sem tutoriais estou meio q apanhando. Desde já, obrigada!
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Olá, Priscila!
Infelizmente não conheço o pacote… Normalmente um bom começo é conferir se existe material nos Vignettes na página do pacote no CRAN. No caso deste pacote, verifiquei que há um tutorial lá:
Clique para acessar o FAOSTAT.pdf
Espero que ajude.
Abraços!
Prof Marcos
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Bom dia professor,
Estou no início do meu aprendizado no pacote R, agradeço desde já, seu material está ajudando muito. Porém, preciso saber sobre as análises em NMDS para meu doutorado. Você teria algum material para ajudar ? Agradeço muito.
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Olá, Suelen!
Que bom, fico feliz do material te ajudar.
Eu ainda não fiz um tutorial de NMDS, mas você deve poder aproveitar um pouco do material de um curso que eu ministrei, está aqui:
A parte de NMDS deve estar no quarto ou quinto dia.
Um ótimo material de multivariada para o R, voltado para a área de Ecologia, está no livro Numerical Ecology With R. O livro é pago, mas os scripts e dados podem ser baixados direto do site, aqui: http://adn.biol.umontreal.ca/~numericalecology/numecolR/
Espero que ajude!
Abraços
Prof Marcos
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Muito obrigada, professor.
Vai ajudar sim.
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Ei Professor!
Achei muito legal o seu Cantinho do R!!! Sensacional!!!
Eu tenho a seguinte dúvida quanto a curva de acumulação. Posso usar a rarefação em dados que não são para acúmulo de espécies? Digo isto porque quero reduzir o meu esforço amostral sem perder informação. Eu quero saber quantas folhas são necessárias para eu amostrar a taxa de herbivoria. Seriam 50? 100? Ou 150? Então no meu eixo Y seria a taxa de herbivoria e no meu eixo X o número de folhas. Quero ver se a partir de um número X de folhas a taxa de herbivoria se mantem, não sendo necessário amostrar mais folhas. É possível fazer isso no R?
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Olá!
Desculpe a demora…
Então, acho que faria sim sentido pensar em uma curva de acúmulo de outra medida além da riqueza (elas também são feitas para índices de diversidade, por exemplo). Mas não sei se isso se aplica neste caso, pois não acho que a herbivoria se “acumule” com as folhas – depende da forma como você está medindo.
Se a herbivoria é uma media por folha, como uma porcentagem ou outra medida relativa, então não teríamos um acúmulo ao considerar cada vez mais folhas, de forma que o método não se aplicaria…
Abraços!
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Parabens professor pelo material, eu tambem dou aulas de R, AED e analisis espacial de dados. Posso indicar sua apostila de Rmarkdown como referencia? Ia fazer uma mas a sua esta perfeita para iniciantes e as minhas aulas sao todas em Rmarkdown. Obrigado
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Olá, Walter
Claro, fico muito feliz de saber que você irá usar o material, e com certeza pode indicá-lo à vontade.
Abraços!
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ola prof Dr Marcos,
Sou novo no R, e adorei suas explicações. Sou biólogo, doutorando em ecologia, pela UFC.
Fiquei fascinado pelo uso do sig via R. Sabe dizer, como faço para acessar os mapas das Unidades de Conservação (UC), especialmente de Aiuaba, Sete Cidades e de Ubajara.
Obrigado
Luis Gonzaga S Jr
Prof da UECE, email lgsjce@yahoo.com.br
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Olá, Luiz! Desculpe a demora em responder.
Espero que o material do blog ajude!
Então, se você procura por shapefiles de UCs, é provável que encontre nos sites dos órgãos ambientais. Tente estes:
http://www.icmbio.gov.br/portal/geoprocessamentos/51-menu-servicos/4004-downloads-mapa-tematico-e-dados-geoestatisticos-das-uc-s
http://www.mma.gov.br/areas-protegidas/cadastro-nacional-de-ucs/dados-georreferenciados
https://mapas.ibge.gov.br/tematicos/unidades-de-conservacao
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Parabéns Marcos pelo seu belo trabalho !!!! Como ele é importante para estimular um iniciante no R !!!! Marcus, você saberia dizer se é possível integrar as planilhas de Excel do Office Libre com o R? Grata, Laura Jane
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Obrigado, Laura!
Então, existe um pacote que deve funcionar para isso, o readODS: https://cran.r-project.org/web/packages/readODS/README.html
Eu nunca usei, mas deve funcionar tranquilamente.
Uma outra opção, que vale para qualquer gerenciador de planilhas, é salvar os dados no formato csv e usar a função read.csv.
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olá Marcos. Obrigada mesmo. Confesso que a anos tento usar o R sem muito sucesso. Mas agora vou conseguir e evoluir.
Abraços Amanda
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Boa tarde, prof. Marcos.
Uso o R Studio e estou tentando baixar os pacotes “rgdal” e “ggmap”. Mas, infelizmente dá o seguinte erro:
ERROR: configuration failed for package ‘openssl’
* removing ‘/home/andressa/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/openssl’
Warning in install.packages :
installation of package ‘openssl’ had non-zero exit status
ERROR: dependencies ‘curl’, ‘openssl’ are not available for package ‘httr’
* removing ‘/home/andressa/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/httr’
Warning in install.packages :
installation of package ‘httr’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘httr’ is not available for package ‘ggmap’
* removing ‘/home/andressa/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/ggmap’
Warning in install.packages :
installation of package ‘ggmap’ had non-zero exit status
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpSQG1r7/downloaded_packages’
>
Se puder me ajudar, agradeço demais.
Abraço
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Oi, Andressa, tudo bem?
Não sei dizer a origem do problema, mas um chute para uma solução seria tentar instalar os pacotes a partir de arquivos locais. Você baixa o pacote em uma pasta compactada do CRAN, e depois, via menu mesmo, escolhe a opção de instalar de arquivos locais. Veja se funciona, ok?
Abraços!
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Muito obrigada, prof. Marcos.
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Esses materiais foram um super achado e irão me ajudar bastante.Fico super grata pelo material sr. Marcos (xará de sobrenome), ainda mais nessa época de quarentena.
Abraço e obrigado
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Oi, Ana!
Que bom que o material foi útil para você, fico muito feliz em saber!
E será que somos parentes?
Abraços!
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Boa noite, Marcos!
Estou tendo um problema para geração da curva de rarefação. Utilizando o rarecurve do vegan, o gráfico gerado é uma reta. Você poderia me auxiliar?
Parabéns pelo trabalho e material riquíssimo!
Obrigado!
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Oi, Felipe.
Isto acontece com qualquer conjunto de dados, ou apenas com um específico? Existe a possibilidade da função estar funcionando normalmente, e os dados serem a fonte do “problema”. Tente testar com dados de exemplo, podem ser do próprio R (como os dados ‘dune’ do pacote vegan, por exemplo).
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Obrigado por responder, Marcos!
Testei com os dados ‘BCI’ e ‘dune’, no entanto não encontrei o mesmo “problema”. Achei estranho, pois aparentemente apenas com o comando rarecurve isso ocorre (a curva de acumulação eu consegui elaborar).
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Boa noite!
Professor conheci agora o blog, e gostaria de saber se vc tem um curso, preciso muito aprender sobre R
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Olá, Gleidiany, tudo bem?
No momento não tenho cursos com inscrições abertas, mas estou com um novo projeto em andamento, e em breve devo trazer novidades. Eu com certeza vou postar aqui no blog, então é só ficar acompanhando por aqui.
Abraços!
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Excelente didática. Parabéns!
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Obrigado, Guilherme!
E em breve (mas pode levar alguns meses ainda) teremos uma apostila completamente nova! É só aguardar. 😉
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