Curvas de acúmulo de espécies bonitinhas no vegan!

Yeahhhhhhhhh!!!!!

Depois de um longo e tenebroso período sem novos tutoriais, tá aqui um saindo fresquinho do forno! 😀

Galera, é o seguinte: como já comentei por aqui, a apostila nova está em andamento. Eu andei mexendo e remexendo, mudando o formato que tinha planejado e umas coisas assim, por isso a demora. Na verdade já estou com um pedaço pronto, e em breve começa a sair. Mas aí, depois de muito demorar, achei que seria bacana continuar entregando os tutoriais tradicionais, que depois poderão ser incorporados ao material novo. 😉

Então, sem mais enrolação, aqui está o nosso mais novo tutorial, que de quebra vem com uma função para você baixar e usar:

Curvas de acúmulo de espécies bonitinhas

Resumidamente: o tutorial ensina como pegar uma curva de acúmulo de espécies gerada pelo pacote vegan e apresentá-la com um gráfico mais bonitinho que o padrão usado pelo pacote. Espero que seja útil!

Um agradecimento especial para a turma de Ferramentas Computacionais em Ecologia de 2016, pois foi durante uma das aulas que montamos este script.

Abraços, e até breve!

Prof Marcos

 

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5 ideias sobre “Curvas de acúmulo de espécies bonitinhas no vegan!

  1. Neucir Szinwelski

    Oi Marcos. Obrigado pelo post. Excelente. Queria saber como eu posso fazer várias curvas num mesmo gráfico. Por exemplo se eu tiver vários níveis para comparar. É possível?

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    Resposta
    1. Marcos V C Vital Autor do post

      Oi, Neucir! Desculpe a demora em responder, a correria anda grande, hehe

      Então, não tem muito mistério não. Se você quer adicionar pontos, basta trocar a função plot pela função points, pois vai funcionar da mesma forma. Do mesmo jeito, você pode adicionar uma nova linha com a função lines. E por aí vai.

      O segredo é adicionar com novos padrões: usar outra cor ou símbolo (pch) no points e também alterar a cor e o padrão (lty) no caso da linha.

      Qualquer coisa avise se não conseguir que eu mostro um passo a passo, ok?

      Abração!

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      Resposta
    2. Ana Lucia Hanisch

      Bom dia, professor. Tudo bom? Feliz 2018!!!
      Fiz o curso do Ipê ano passado e estou usando o script do “rank de abundância” que achei ótimo.
      Só tem um probleminha: vc não passou como colocar a legenda no gráfico e eu não estou conseguindo sozinha. Poderia me ajudar por favor. Preciso desse gráfico para minha tese…
      Abçs

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      Resposta
      1. Marcos V C Vital Autor do post

        Olá, Ana Lucia, tudo bem?

        Desculpe a demora em responder. 😉

        Então, tudo depende do que você quer na legenda. Em gráficos como este, basta usar a função legend(), estabelecer a posição, o texto e os símbolos. É normalmente bem simples, veja um exemplo genérico (basta copiar e colar no R para rodar):

        #Dados de exemplo
        data(iris)
        summary(iris)

        levels(iris$Species) #Conferindo a ordem das espécies
        cores<-c("green4", "red4", "blue4")

        plot(iris$Sepal.Length~iris$Sepal.Width, pch=16, col=cores[iris$Species])
        legend("topright", legend=levels(iris$Species), pch=16, col=cores)

        Abraços!

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